При изборите от 1800 г. нямаше официални кандидати за вицепрезидент. Според конституцията на САЩ избирателите направиха два избора за президент и който получи най-много гласове, стана президент. Лицето с втория най-много гласове стана вицепрезидент. Това ще се промени с приемането на 12-та поправка.
Въпреки че няма официален кандидат за вицепрезидент, Томас Джеферсън се кандидатира с Аарон Бър като негова управляваща половинка. Техният „билет“ получи най-много гласове и решението кой да бъде президент бе дадено на избирателите. Джон Адамс беше сдвоен или с Пинкни, или с Джей. Според Националния архив обаче не се води официален запис на броя на популярните гласове.
Между Томас Джеферсън и Аарон Бър имаше 73 гласа при всеки глас. Поради това Камарата на представителите трябваше да реши кой ще бъде президент и кой ще бъде вицепрезидент. Поради интензивна кампания от Александър Хамилтън, Томас Джеферсън беше избран над Арън Бър след 35 бюлетини. Действията на Хамилтън биха били един фактор, довел до смъртта му в двубой с Бър през 1804г.