Катастрофални наводнения на Жълта река измиха реколтата, удавиха селяни и промениха течението на реката, така че вече да не се среща с Големия канал. Гладните оцелели от тези катастрофи започнаха да мислят, че техните етнически-монголски владетели, о Династия Юан, бяха загубили Мандат на небето. Когато същите тези владетели принудиха 150 000 до 200 000 от своите китайски поданици на Хан да се окажат за масивна трудова трупа, която да изкопае канала още веднъж и да се присъедини към реката, работниците въстанаха. Това въстание, наречено въстание на Червения тюрбан, означава началото на края за властта на Монгол над Китай.
Първият лидер на Червените турбани Хан Шантонг набира последователите си от принудителните работници, които копаят канала през 1351 година. Дядото на Хан беше лидер на сектата на Белия лотос, която осигуряваше религиозните основания за въстанието на Червения тюрбан. Властите на династията Юан скоро плениха и екзекутираха Хан Шантонг, но синът му зае мястото му начело на бунта. И двамата Ханс успяха да играят на глада на своите последователи, като недоволството им беше принудено да работи без заплащане на правителството и дълбокото им неприязън да бъдат управлявани от "варвари" от Монголия. В Северен Китай това доведе до експлозия на антиправителствената дейност на Червените тюрбани.
Междувременно в Южен Китай започна второ въстание в Червен тюрбан под ръководството на Сю Шууи. Той имаше подобни оплаквания и цели като тези на северните Червени турбани, но двете не бяха координирани по никакъв начин.
Въпреки че първоначално селските войници се идентифицираха с цвета бял (от Обществото на белия лотос), те скоро преминаха към много по-късния цвят червен. За да се идентифицират, те носеха червени ленти за глава или Хонг Джин, което даде на въстанието общото му име като „Червеният турбански бунт“. Въоръжен с импровизирани оръжия и селскостопански инструменти, те не би трябвало да са истинска заплаха за армиите на централното правителство, водени от Монгол, но династията Юан беше в смут.
Първоначално един способен командир, наречен главен съветник Тогто, успя да събере ефективна сила от 100 000 императорски войници, които да свалят северните червени турбани. Той успява през 1352 г., като разгромява армията на Хан. През 1354 г. Червените турбани отново преминават в настъпление, прерязвайки Големия канал. Тогто събра сила, която традиционно наброяваше 1 милион, въпреки че това несъмнено е грубо преувеличение. Точно когато той започна да се движи срещу Червените турбани, съдебните интриги доведоха до това, че императорът уволнява Тогто. Неговите възмутени офицери и много от войниците дезертираха в знак на протест срещу отстраняването му, а юанският съд така и не успя да намери друг ефективен генерал, който да ръководи усилията на анти-червените тюрбани.
През края на 1350-те и началото на 1360-те местните лидери на Червените турбани се борят помежду си за контрол над войниците и територията. Те изразходваха толкова много енергия един за друг, че правителството на Юан бе оставено в относително спокойствие за известно време. Изглежда, че бунтът може да се срине под тежестта на амбицията на различни военачалници.
Въпреки това синът на Хан Шантонг умира през 1366 г.; някои историци смятат, че неговият генерал Джу Юанджан го е удавил. Въпреки че са били необходими още две години, Джу води своята селска армия да превземе монголската столица в Даду (Пекин) през 1368 година. Династията Юан падна и Жу установи нов, етнически Хан Китайски династия, наречена Минг.