Условията, които плениха войници от Съюза, издържаха в конфедерацията Андерсонвилски затвор бяха ужасяващи. През 18-те месеца, в които затворът функционира, от него загинаха близо 13 000 войници от Съюза недохранване, болести и излагане на елементи поради нечовешко отношение от командира на Андерсън Хенри Вирц. Така че наистина не трябва да е изненада, че съдебното му преследване за военни престъпления след капитулацията на Юга е най-известният процес, произтичащ от Гражданска война. Но не е толкова общоизвестно, че е имало почти хиляда други военни преследвания на конфедератите. Много от тях се дължат на малтретирането на заловени войници от Съюза.
Хенри Вирц
Хенри Вирц пое командването на затвора Андерсънвил на 27 март 1864 г., около месец след като първите затворници пристигнаха там. Един от първите действия на Wirz беше да създаде зона, наречена ограда от мъртва линия, предназначена за повишаване на сигурността, като държи затворниците далеч от стената на затвора. Всеки затворник, преминал „мъртвата линия“, подлежи на разстрел от охраната на затвора. По време на управлението на Wirz като командир, той използва заплахи, за да поддържа затворниците в ред. Когато изглежда, че заплахите не действат, Вирц нареди часове да разстрелят затворници. в
Май 1865г, Wirz е арестуван в Andersonville и транспортиран до Вашингтон. да чакаме изпитание. Wirz бе съден за заговор за нараняване и / или убиване на заловени войници, като неправилно им отказа достъп до храна, медицински консумативи и дрехи. Той беше обвинен и в убийство за лично екзекутиране на редица затворници.Приблизително 150 свидетели свидетелстват срещу Вирз на военния му процес, който продължи от 23 август до 18 октомври 1865 г. След като е признат за виновен по всички обвинения срещу него, Вирц е осъден на смърт и обесен на 10 ноември 1865 г.
Джеймс Дънкан
Джеймс Дънкан беше друг офицер от затвора Андерсънвил, който също беше арестуван. Дънкан, който беше назначен в офиса на началника, беше осъден за убийство за умишлено задържане на храна от затворниците. Той беше осъден на 15 години тежък труд, но избяга, след като изтърпя само една година от присъдата си.
Шамп Фъргюсън
В началото на Гражданската война Шамп Фъргюсън е фермер в Източен Тенеси. Населението на тази област беше сравнително равномерно разделено между подкрепата на Съюза и Конфедерацията. Фъргюсън организира партизанска компания, която атакува и убива симпатизанти на Съюза. Фъргюсън също действа като разузнавач за полковник Кавалерията на Кентъки на Джон Хънт Морган, а Морган повиши Фъргюсън в чин капитан на партизани Рейнджърс. Конфедеративният конгрес прие мярка, наречена Закон за партизанския рейнджър, която позволява набирането на нелегални служители. Трябва да се отбележи, че поради липса на дисциплина сред партизанските рейнджъри, ген Робърт Е. завет призовава за отмяна на закона от Конфедеративния конгрес през февруари 1864г. След процес пред военен трибунал Фъргюсън беше осъден за убийството на повече от 50 заловени войници на Съюза. Той е екзекутиран чрез обесване през октомври 1865г.
Робърт Кенеди
Робърт Кенеди беше офицер от конфедерацията, който беше пленен от силите на Съюза и бе хвърлен в затвора във военния затвор на Джонсън. Затворът се намираше в залива Сандаски, който е на брега на езерото Ери, само на няколко мили от Сандаски, Охайо. Кенеди избяга от острова на Джонсън през октомври 1864 г., пробивайки се в Канада - който поддържаше неутралитет към двете страни. Кенеди се срещна с няколко офицери от Конфедерацията, които използват Канада като стартова площадка за провеждане на военни действия срещу Съюза. Той участва в заговор за започване на пожари в множество хотели, както и в музей и театър в Ню Йорк, с намерението да затрупа местните власти. Всички пожари бяха или угасени бързо, или не успяха да нанесат щети. Кенеди беше единственият, който беше заловен. След процес пред военен трибунал Кенеди е екзекутиран чрез обесване през март 1865 г.